Génome de la pomme de terre décodé : des chercheurs découvrent de grandes différences !

Génome de la pomme de terre décodé : des chercheurs découvrent de grandes différences !

Des chercheurs de l'Université Ludwig Maximilians (LMU) et de l'Institut Max Planck de recherche en sélection végétale ont réalisé des progrès significatifs dans le décodage du génome européen de la pomme de terre. Le 16 avril 2025, il a été annoncé que les scientifiques avaient reconstruit le génome de dix variétés historiques de pommes de terre, décodant 85 % de la variabilité de toutes les pommes de terre cultivées. Ce travail est particulièrement pertinent car la pomme de terre est un aliment de base pour plus de 1,3 milliard de personnes dans le monde.

L’une des principales conclusions de cette recherche est que le pool génétique de la pomme de terre est limité, mais qu’il existe des différences significatives entre les copies individuelles des chromosomes. Ces différences sont jusqu’à vingt fois supérieures à la variabilité génétique chez l’homme. Cette diversité est probablement née d'un mélange avec des espèces sauvages en Amérique du Sud avant l'introduction de la pomme de terre en Europe. Le professeur Korbinian Schneeberger et son équipe ont utilisé des variétés historiques du XVIIIe siècle pour leurs analyses afin de mettre en lumière le goulot d'étranglement génétique créé par des maladies telles que la brûlure des tubercules et l'importation de pommes de terre d'Amérique du Sud. [ots.at]

Nouvelles méthodes d’analyse du génome de la pomme de terre

Les chercheurs ont également développé une nouvelle méthode pour analyser les quelque 2 000 variétés de pommes de terre enregistrées dans l'UE. Cette technique pourrait jouer un rôle de soutien dans la sélection car elle pourrait contribuer à rendre la sélection plus réussie et plus efficace. Les approches nouvellement développées ont été testées avec succès sur la variété de pomme de terre très répandue Russet Burbank. Cela pourrait non seulement améliorer la sélection de variétés traditionnelles, mais également de nouvelles méthodes de modification du génome, qui seraient cruciales pour la sélection future.

Le génome complexe de la pomme de terre, composé de quatre génomes par cellule, pose des défis particuliers à la sélection traditionnelle. Un consortium de près de 100 scientifiques et 29 instituts de recherche internationaux a également séquencé presque complètement le génome de la pomme de terre. 86 pour cent du total de 844 millions de paires de bases et 39 000 gènes codant pour des protéines ont été identifiés. Les résultats de cette analyse approfondie ont été publiés dans la célèbre revue « Nature ». [plantresearch.de].

Développements évolutifs et défis de sélection

Le séquençage de la pomme de terre a permis d'identifier des gènes importants et cruciaux pour le développement du tubercule et le stockage de l'amidon. En outre, des gènes ont été découverts qui influencent la sensibilité aux ravageurs et aux maladies, qui représentent les plus grands problèmes de culture. La connaissance de ces informations génétiques est cruciale pour le développement de variétés résistantes et pourrait accroître l’efficacité de la sélection de pommes de terre à long terme.

Dans l’ensemble, la recherche suggère que de nouvelles opportunités en matière de sélection de pommes de terre peuvent être explorées malgré les défis posés par le pool génétique limité et la structure génétique complexe. Cela pourrait non seulement accroître la qualité mais aussi la résilience de la pomme de terre en tant qu’aliment pour une population mondiale croissante.